安徽中醫(yī)藥大學(xué)創(chuàng)建于1959年，其前身為1952年創(chuàng)立的安徽省中醫(yī)進修班。1959年，安徽省政府正式批準(zhǔn)成立安徽中醫(yī)學(xué)院。1970年，安徽中醫(yī)學(xué)院并入安徽醫(yī)學(xué)院。1975年，國家教育部批準(zhǔn)恢復(fù)安徽中醫(yī)學(xué)院。2000年，安徽省醫(yī)藥學(xué)校并入安徽中醫(yī)學(xué)院。2011年，省政府批準(zhǔn)在安徽中醫(yī)學(xué)院的基礎(chǔ)上組建成立安徽省中醫(yī)藥科學(xué)院。2013年，教育部同意安徽中醫(yī)學(xué)院更名為安徽中醫(yī)藥大學(xué)。

學(xué)校是國家中醫(yī)臨床研究基地、國家中醫(yī)藥國際合作基地、國家藥品臨床研究基地，國家博士授權(quán)單位、碩士研究生推薦免試單位。有少荃湖、梅山路、史河路、六安路四個校區(qū)，全日制學(xué)生19502人（含博士生135人、碩士生3151人），有17個二級院部（含3所直屬附屬醫(yī)院），7所非直屬附屬醫(yī)院。

學(xué)校現(xiàn)有教職工4754人，其中副高以上職稱人員961人。有國醫(yī)大師2人，國家杰青1人，岐黃學(xué)者1人，全國名中醫(yī)4人，青年岐黃學(xué)者3人，皖江學(xué)者1人，青年皖江學(xué)者3人，省特支計劃創(chuàng)新領(lǐng)軍人才10人，省杰青5人，省優(yōu)青4人，國家名老中醫(yī)學(xué)術(shù)經(jīng)驗項目指導(dǎo)教師56人，享受國務(wù)院特殊津貼27人、省政府特殊津貼12人，安徽省領(lǐng)軍人才團隊3個，省“115”產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團隊8個。有博士生導(dǎo)師144人，碩士生導(dǎo)師926人，博士后流動工作站2個。

學(xué)校現(xiàn)有28個本科專業(yè)，6個國家級一流本科專業(yè)建設(shè)點，10個省級一流專業(yè)建設(shè)點，8門國家級一流本科課程。有3個一級學(xué)科及1個專業(yè)學(xué)位類別（領(lǐng)域）博士學(xué)位授權(quán)點，6個一級學(xué)科及4個專業(yè)學(xué)位類別（領(lǐng)域）碩士學(xué)位授權(quán)點。有安徽省Ⅱ類、Ⅲ類高峰學(xué)科各1個，安徽省高峰培育學(xué)科4個，安徽省學(xué)科建設(shè)重大項目2個，國家中醫(yī)藥管理局重點學(xué)科17個，安徽省A類重點學(xué)科1個，安徽省B類重點學(xué)科12個，進入ESI全球排名前1%學(xué)科1個。有國家中醫(yī)區(qū)域醫(yī)療中心1個，國家區(qū)域中醫(yī)（專科）診療中心3個，國家臨床重點專科9個，國家中醫(yī)藥管理局重點學(xué)科17個、重點專科22個。

學(xué)校以人才培養(yǎng)為第一要務(wù)，現(xiàn)有2個國家級教學(xué)團隊，29個省級教學(xué)團隊，2個國家級實驗教學(xué)示范中心，1個國家級中醫(yī)臨床教學(xué)培訓(xùn)示范中心，1個國家級專業(yè)綜合改革試點項目，2個國家級卓越醫(yī)生（中醫(yī)）教育培養(yǎng)計劃，2位國家中醫(yī)藥高等學(xué)校教學(xué)名師。獲國家級、省級質(zhì)量工程項目700余項，國家級教學(xué)成果一等獎1項、二等獎3項，省級教學(xué)成果特等獎6項、一等獎21項。

學(xué)校注重學(xué)生綜合能力培養(yǎng)，設(shè)立大學(xué)生課外學(xué)術(shù)科技創(chuàng)新與創(chuàng)業(yè)基金和贏卓獎學(xué)金，開展“百人獲獎、千人參與、萬人受益”的大學(xué)生知識技能競賽，獲國家級A類賽事一等獎6項。學(xué)校重視實踐育人，榮獲全國大中專學(xué)生志愿者暑期“三下鄉(xiāng)”社會實踐、全國紅十字模范單位、 “七彩假期”志愿服務(wù)全國示范單位等榮譽稱號，1名同學(xué)獲全國大學(xué)生年度人物提名獎。活動優(yōu)秀單位等榮譽稱號。學(xué)校近5年畢業(yè)生平均就業(yè)率94%。

學(xué)校大力推進科技強校戰(zhàn)略，近5年來，共承擔(dān)各級科研項目近2000項，其中國家級項目近200項；獲省部級以上科技獎勵68項，其中國家科學(xué)技術(shù)二等獎1項，省部級一等獎6項；發(fā)表高水平科研論文900余篇，其中中科院二區(qū)以上論文200余篇；獲授權(quán)發(fā)明專利60余項。2017年學(xué)校獲批國家重點研發(fā)計劃項目，現(xiàn)有12個省級科技創(chuàng)新團隊，30個省部級以上科技創(chuàng)新平臺。

學(xué)校不斷強化服務(wù)地方經(jīng)濟發(fā)展能力，圍繞以中醫(yī)藥為主的科技開發(fā)和科技服務(wù)，加強與地方政府產(chǎn)學(xué)研合作，與黃山、亳州、六安等17個市縣人民政府及一大批國內(nèi)知名中醫(yī)藥企業(yè)建有50余個產(chǎn)學(xué)研合作基地。建立了安徽省中藥材科技產(chǎn)業(yè)戰(zhàn)略聯(lián)盟，獲“全國科技特派員工作先進集體”“中醫(yī)藥科技管理工作先進集體”“推動中醫(yī)藥學(xué)術(shù)發(fā)展特別貢獻獎”等稱號和榮譽。

學(xué)校積極拓展國際教育與交流，與美國、澳大利亞、德國、希臘、馬來西亞、日本等20多個國家和地區(qū)的40多個醫(yī)療和教育機構(gòu)建立了友好合作關(guān)系。在希臘設(shè)立安徽省第一個海外中醫(yī)藥中心——安徽中醫(yī)藥大學(xué)雅典中醫(yī)藥中心。先后有10多個國家和地區(qū)的學(xué)員來校攻讀博士、碩士、學(xué)士學(xué)位以及參加中短期培訓(xùn)。

學(xué)校注重提升醫(yī)療服務(wù)水平，第一附屬醫(yī)院是全省最大的三級甲等綜合性中醫(yī)醫(yī)院；第二附屬醫(yī)院是全國首家也是規(guī)模最大的三級甲等針灸專科醫(yī)院；第三附屬醫(yī)院是國家第三批重點建設(shè)的中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院；國醫(yī)堂是一所以純中醫(yī)方式為主要醫(yī)療手段的醫(yī)療單位。

目前，學(xué)校立足“四新”建設(shè)，緊緊圍繞“雙一流”建設(shè)目標(biāo)，以中醫(yī)藥學(xué)科為主體，統(tǒng)籌推進中醫(yī)藥學(xué)與理學(xué)、工學(xué)、管理學(xué)、經(jīng)濟學(xué)、文學(xué)類的協(xié)同發(fā)展，構(gòu)建完善多學(xué)科交叉融合、相互支撐、協(xié)調(diào)發(fā)展、特色鮮明的學(xué)科專業(yè)體系。面向未來，學(xué)校將繼續(xù)堅持“質(zhì)量立校、人才興校、科技強校、文化潤校、依法治校、開放榮校”六大戰(zhàn)略，秉持“北華佗、南新安”辦學(xué)特色，全面構(gòu)筑中醫(yī)藥人才培養(yǎng)、科技創(chuàng)新、社會服務(wù)、文化傳承、對外交流高地，引領(lǐng)安徽中醫(yī)藥事業(yè)產(chǎn)業(yè)發(fā)展，為建設(shè)現(xiàn)代化美好安徽、服務(wù)人民大眾健康作出更大貢獻。