復旦大學上海醫學院（簡稱“復旦上醫”）地處上海市徐匯區，創建于1927年，創立時名為國立第四中山大學醫學院，是中國人創辦的第一所國立大學醫學院，顏福慶出任首任院長。1932年，獨立為國立上海醫學院。院訓是“正誼明道”，出自《漢書·董仲舒傳》：正其誼不謀其利，明其道不計其功。1939年，因抗戰爆發內遷至云南昆明。1940年，輾轉遷至四川重慶。1946年，抗戰勝利，遷回上海。1952年，更名為上海第一醫學院。1959年，被定為全國16所重點高等學府之一。1985年，更名為上海醫科大學。2000年，上海醫科大學和復旦大學合并辦學，組建成為新的復旦大學。2012年，新的上海醫學院成立，作為復旦大學黨政的派出機構，根據學校的授權，在大醫口的人才培養、科學研究、學科建設、發展規劃、資源配置、對外交流等方面，行使相對獨立的管理權限。2017年，中共復旦大學上海醫學院工作委員會成立，是學校黨委的派出機構。2018年12月21日，教育部、國家衛生健康委員會、上海市人民政府正式簽約，共建托管復旦大學上海醫學院及其直屬附屬醫院。2019年6月14日，復旦大學上海醫學院領導班子宣布會議舉行。上海市委決定，建立中共復旦大學上海醫學院委員會和中共復旦大學上海醫學院紀律檢查委員會。同日，復旦大學上海醫學院高水平地方高校試點建設正式啟動。

復旦大學上海醫學院設有本科專業10個：臨床醫學（八年制）、臨床醫學（五年制）、臨床醫學（六年制）、口腔醫學、基礎醫學、法醫學、預防醫學、公共事業管理、藥學、護理學。現有博士學位授予權的一級學科9個（醫學門類6個，非醫學門類3個），設有博士后科研流動站8個：生物學、基礎醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合、藥學、公共管理（醫）、護理學。

復旦大學上海醫學院擁有中國科學院院士10人，中國工程院院士5人，有國家級高層次人才200余人，其中國家級青年人才100余人。截至2021年底，有在校博士研究生3477人，碩士研究生3338人，普通本科生4149人，共計10964人。有專任教師716人、專職科研人員161人，其中具有高級職稱576人。

復旦大學上海醫學院設有直屬院系所10個：基礎醫學院、臨床醫學院、公共衛生學院、藥學院、護理學院、生物醫學研究院、腦科學研究院、放射醫學研究所、實驗動物科學部、腦科學轉化研究院。有附屬醫院18所（含籌）：復旦大學附屬中山醫院、復旦大學附屬華山醫院、復旦大學附屬腫瘤醫院、復旦大學附屬婦產科醫院、復旦大學附屬兒科醫院、復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院、復旦大學附屬金山醫院、復旦大學附屬上海市第五人民醫院、上海市（復旦大學附屬）公共衛生臨床中心、復旦大學附屬華東醫院、復旦大學附屬浦東醫院、復旦大學附屬靜安區中心醫院、復旦大學附屬閔行醫院、復旦大學附屬質子重離子醫院、復旦大學附屬青浦區中心醫院、復旦大學附屬徐匯醫院、復旦大學附屬精神衛生中心（籌）、復旦大學附屬口腔醫院（籌）。

復旦大學上海醫學院現有基礎醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合、藥學、護理學6個一級學科，口腔醫學一級學科也正在籌建中。其中基礎醫學、臨床醫學、藥學、中西醫結合4個學科入選為首輪國家“雙一流”建設學科，基礎醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合3個學科入選上海高峰學科建設計劃。有國家老年疾病臨床醫學研究中心、國家放射與治療臨床醫學研究中心和國家兒童醫學中心（上海）、國家神經疾病醫學中心、國家傳染病醫學中心；有國家重點實驗室1個：醫學神經生物學；教育部重點實驗室5個：醫學分子病毒學、代謝分子醫學、智能化遞藥、公共衛生安全、癌變與侵襲原理；教育部前沿科學中心1個：腦科學；國家衛健委（衛生部）重點實驗室9個：糖復合物、抗生素臨床藥理、手功能重建、衛生技術評估、醫學分子病毒學、聽覺醫學、近視眼、病毒性心臟病、新生兒疾病，上海市重點實驗室14個：周圍神經顯微外科、醫學圖像處理與計算機輔助技術、器官移植、女性生殖內分泌相關疾病、腎臟疾病與血液凈化、視覺損害與重建、乳腺腫瘤、出生缺陷防治、老年醫學臨床、醫學表觀遺傳學、肺部炎癥與損傷、腦功能重塑及神經再生、傳染病與生物安全應急響應、放射腫瘤學。